MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Anaplasma marginale str. St. Maries chromosome

Total Repeats: 20269

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_004842	CCGG	2	8	342576	342583	0 %	0 %	50 %	50 %	56416630
5502	NC_004842	GTCAAT	2	12	342584	342595	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	56416630
5503	NC_004842	TCA	2	6	342603	342608	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5504	NC_004842	CAT	2	6	342641	342646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5505	NC_004842	CCA	2	6	342657	342662	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416630
5506	NC_004842	TGC	2	6	342698	342703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5507	NC_004842	T	6	6	342719	342724	0 %	100 %	0 %	0 %	56416630
5508	NC_004842	CAG	2	6	342733	342738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5509	NC_004842	GAA	2	6	342824	342829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416630
5510	NC_004842	CGC	2	6	342844	342849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
5511	NC_004842	CAT	2	6	342856	342861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5512	NC_004842	AAG	2	6	342938	342943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416630
5513	NC_004842	CAG	2	6	343000	343005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5514	NC_004842	TG	3	6	343017	343022	0 %	50 %	50 %	0 %	56416630
5515	NC_004842	T	6	6	343061	343066	0 %	100 %	0 %	0 %	56416630
5516	NC_004842	GAA	2	6	343082	343087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416630
5517	NC_004842	ACT	2	6	343100	343105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5518	NC_004842	ATC	2	6	343121	343126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5519	NC_004842	CCA	3	9	343131	343139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416630
5520	NC_004842	CCG	2	6	343146	343151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
5521	NC_004842	GCC	3	9	343173	343181	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
5522	NC_004842	GC	3	6	343186	343191	0 %	0 %	50 %	50 %	56416630
5523	NC_004842	CTG	2	6	343202	343207	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5524	NC_004842	AGG	2	6	343220	343225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416630
5525	NC_004842	TTG	2	6	343376	343381	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416630
5526	NC_004842	GCA	2	6	343428	343433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5527	NC_004842	TGT	2	6	343458	343463	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416630
5528	NC_004842	TTG	2	6	343469	343474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416630
5529	NC_004842	GCG	2	6	343497	343502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416630
5530	NC_004842	CTT	2	6	343507	343512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5531	NC_004842	TTC	2	6	343553	343558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5532	NC_004842	GCCT	2	8	343589	343596	0 %	25 %	25 %	50 %	56416630
5533	NC_004842	TAG	2	6	343603	343608	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416630
5534	NC_004842	CCTTGC	2	12	343618	343629	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	56416630
5535	NC_004842	CCT	2	6	343632	343637	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416630
5536	NC_004842	CTT	2	6	343667	343672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5537	NC_004842	GCT	2	6	343673	343678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5538	NC_004842	CTG	2	6	343720	343725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5539	NC_004842	TGT	2	6	343743	343748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416630
5540	NC_004842	A	6	6	343784	343789	100 %	0 %	0 %	0 %	56416630
5541	NC_004842	GC	3	6	343807	343812	0 %	0 %	50 %	50 %	56416630
5542	NC_004842	AAG	2	6	343881	343886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416630
5543	NC_004842	TGC	2	6	343955	343960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5544	NC_004842	CT	3	6	344013	344018	0 %	50 %	0 %	50 %	56416630
5545	NC_004842	CTT	2	6	344024	344029	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5546	NC_004842	CTG	2	6	344042	344047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5547	NC_004842	CAG	2	6	344081	344086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5548	NC_004842	GCT	2	6	344116	344121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5549	NC_004842	TGG	2	6	344131	344136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416630
5550	NC_004842	CTC	3	9	344156	344164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416630
5551	NC_004842	ATC	2	6	344168	344173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5552	NC_004842	TCT	2	6	344191	344196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5553	NC_004842	GCT	2	6	344244	344249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5554	NC_004842	GC	3	6	344313	344318	0 %	0 %	50 %	50 %	56416630
5555	NC_004842	TTC	2	6	344327	344332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5556	NC_004842	ATT	2	6	344339	344344	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416630
5557	NC_004842	TTA	2	6	344352	344357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416630
5558	NC_004842	TTC	2	6	344615	344620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5559	NC_004842	CATTGC	2	12	344624	344635	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	56416630
5560	NC_004842	TCA	2	6	344677	344682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
5561	NC_004842	CGA	2	6	344695	344700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5562	NC_004842	AACAAT	2	12	344826	344837	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	56416630
5563	NC_004842	TGG	2	6	344840	344845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416630
5564	NC_004842	AGA	2	6	344875	344880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	56416630
5565	NC_004842	CT	3	6	344891	344896	0 %	50 %	0 %	50 %	56416630
5566	NC_004842	CTT	2	6	344919	344924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5567	NC_004842	CTG	2	6	344995	345000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5568	NC_004842	GCG	2	6	345018	345023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	56416630
5569	NC_004842	TCCT	2	8	345102	345109	0 %	50 %	0 %	50 %	56416630
5570	NC_004842	GTT	2	6	345157	345162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	56416630
5571	NC_004842	GTA	2	6	345213	345218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416630
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5574	NC_004842	TGG	2	6	345311	345316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	56416630
5575	NC_004842	T	6	6	345326	345331	0 %	100 %	0 %	0 %	56416630
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5578	NC_004842	CAT	2	6	345410	345415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	56416630
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5581	NC_004842	GCC	3	9	345522	345530	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
5582	NC_004842	GCT	2	6	345537	345542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
5583	NC_004842	CAG	3	9	345547	345555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416630
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5585	NC_004842	CTG	3	9	345673	345681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416630
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5587	NC_004842	CTT	2	6	345835	345840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
5588	NC_004842	TCC	2	6	345849	345854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416630
5589	NC_004842	AG	3	6	345863	345868	50 %	0 %	50 %	0 %	56416630
5590	NC_004842	TTCCT	2	10	345900	345909	0 %	60 %	0 %	40 %	56416630
5591	NC_004842	TCT	2	6	345930	345935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	56416630
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5593	NC_004842	CTTT	2	8	345974	345981	0 %	75 %	0 %	25 %	56416630
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5600	NC_004842	TTGT	2	8	346253	346260	0 %	75 %	25 %	0 %	56416630
5601	NC_004842	GCC	2	6	346268	346273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
5602	NC_004842	TGAT	2	8	346277	346284	25 %	50 %	25 %	0 %	56416630
5603	NC_004842	GCGA	2	8	346396	346403	25 %	0 %	50 %	25 %	56416630
5604	NC_004842	CT	3	6	346421	346426	0 %	50 %	0 %	50 %	56416630
5605	NC_004842	CGC	2	6	346465	346470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416630
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5609	NC_004842	ATT	2	6	347255	347260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	56416631
5610	NC_004842	GCA	2	6	347374	347379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	56416631
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5612	NC_004842	CGC	2	6	347500	347505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416631
5613	NC_004842	TTTC	2	8	347540	347547	0 %	75 %	0 %	25 %	56416631
5614	NC_004842	T	6	6	347592	347597	0 %	100 %	0 %	0 %	56416631
5615	NC_004842	TGC	2	6	347599	347604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	56416631
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5617	NC_004842	AAGA	3	12	347658	347669	75 %	0 %	25 %	0 %	56416631
5618	NC_004842	GCC	2	6	347670	347675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	56416631
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5621	NC_004842	TATCC	2	10	347932	347941	20 %	40 %	0 %	40 %	56416632
5622	NC_004842	AG	3	6	347978	347983	50 %	0 %	50 %	0 %	56416632
5623	NC_004842	AT	3	6	348125	348130	50 %	50 %	0 %	0 %	56416632
5624	NC_004842	GC	3	6	348290	348295	0 %	0 %	50 %	50 %	56416632
5625	NC_004842	CAC	2	6	348324	348329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	56416632
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5627	NC_004842	AGT	2	6	348534	348539	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	56416632
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5632	NC_004842	AT	3	6	348973	348978	50 %	50 %	0 %	0 %	56416633
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5636	NC_004842	AG	3	6	349119	349124	50 %	0 %	50 %	0 %	56416633
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5654	NC_004842	TG	4	8	350299	350306	0 %	50 %	50 %	0 %	56416634
5655	NC_004842	TG	3	6	350377	350382	0 %	50 %	50 %	0 %	56416634
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5742	NC_004842	T	6	6	355281	355286	0 %	100 %	0 %	0 %	56416640
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5746	NC_004842	TCC	2	6	355472	355477	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	56416640
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5874	NC_004842	GAG	2	6	363340	363345	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	56416644
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